Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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TRAM2Q15035 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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TRAM2Q15035 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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