Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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