Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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RFTN1Q14699 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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RFTN1Q14699 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RFTN1Q14699 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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