Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms