Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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