Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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