Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms