Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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