Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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