Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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