Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CSTF3Q12996 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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CSTF3Q12996 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CSTF3Q12996 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSTF3Q12996 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CSTF3Q12996 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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