Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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NFIAQ12857 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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NFIAQ12857 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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NFIAQ12857 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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NFIAQ12857 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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NFIAQ12857 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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NFIAQ12857 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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NFIAQ12857 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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NFIAQ12857 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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