Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms