Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms