Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms