Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms