Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms