Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms