Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XPCQ01831 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
XPCQ01831 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
XPCQ01831 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
XPCQ01831 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
XPCQ01831 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
XPCQ01831 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XPCQ01831 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms