Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms