Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms