Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TRA2BP62995 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TRA2BP62995 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TRA2BP62995 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TRA2BP62995 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TRA2BP62995 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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