Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms