Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 NBR1-202ENST00000542611 2703 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 KIAA1671-202ENST00000401395 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 SLC16A7-203ENST00000547379 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 C17orf51-201ENST00000391411 7914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 SLIT2-202ENST00000503823 5233 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 FBN2-201ENST00000262464 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 AL118505.1-201ENST00000619370 1932 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 SZT2-209ENST00000562955 13968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 BTAF1-201ENST00000265990 7250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 SLC12A3-202ENST00000438926 5567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 ZC3H10-201ENST00000257940 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 NSD3-202ENST00000317025 10776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 RNF144B-201ENST00000259939 5036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 SCN4B-201ENST00000324727 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms