Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms