Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms