Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPAP53621 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms