Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA4P51532 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms