Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCLMP48507 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCLMP48507 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCLMP48507 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCLMP48507 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCLMP48507 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCLMP48507 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GCLMP48507 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCLMP48507 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms