Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ME1P48163 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ME1P48163 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms