Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms