Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD4P46934 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms