Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRXP46100 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 CAP2-207ENST00000493172 861 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRXP46100 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRXP46100 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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