Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV4P43268 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV4P43268 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV4P43268 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV4P43268 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV4P43268 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV4P43268 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV4P43268 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV4P43268 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV4P43268 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV4P43268 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV4P43268 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms