Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PPARGP37231 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PPARGP37231 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PPARGP37231 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PPARGP37231 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PPARGP37231 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PPARGP37231 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PPARGP37231 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PPARGP37231 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PPARGP37231 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PPARGP37231 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PPARGP37231 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPARGP37231 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PPARGP37231 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms