Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NTF4P34130 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NTF4P34130 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NTF4P34130 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NTF4P34130 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NTF4P34130 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NTF4P34130 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NTF4P34130 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
NTF4P34130 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF4P34130 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF4P34130 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms