Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL9P32969 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL9P32969 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms