Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPS1P31327 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPS1P31327 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPS1P31327 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CPS1P31327 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPS1P31327 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPS1P31327 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPS1P31327 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CPS1P31327 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPS1P31327 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPS1P31327 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPS1P31327 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPS1P31327 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPS1P31327 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPS1P31327 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPS1P31327 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPS1P31327 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPS1P31327 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPS1P31327 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPS1P31327 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPS1P31327 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPS1P31327 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CPS1P31327 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CPS1P31327 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CPS1P31327 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPS1P31327 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPS1P31327 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms