Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms