Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms