Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFE3P19532 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFE3P19532 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TFE3P19532 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TFE3P19532 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TFE3P19532 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TFE3P19532 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFE3P19532 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TFE3P19532 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFE3P19532 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFE3P19532 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFE3P19532 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFE3P19532 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFE3P19532 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFE3P19532 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFE3P19532 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFE3P19532 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFE3P19532 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFE3P19532 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFE3P19532 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFE3P19532 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFE3P19532 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFE3P19532 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFE3P19532 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFE3P19532 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms