Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIG1P18858 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms