Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms