Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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