Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms