Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms