Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms