Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PRAMEF10O60809 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PRAMEF10O60809 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PRAMEF10O60809 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PRAMEF10O60809 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PRAMEF10O60809 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PRAMEF10O60809 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PRAMEF10O60809 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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