Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms