Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
O00370 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
O00370 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
O00370 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
O00370 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
O00370 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
O00370 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
O00370 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
O00370 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
O00370 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
O00370 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
O00370 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
O00370 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
O00370 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
O00370 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
O00370 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
O00370 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms